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法人人格有法人實在說( real entity theory )及法人虛擬說( fictional theory )相應的所得稅制有採獨立課稅制( Seperate entity approach )及合併課稅制( Integration approach ),而現行所得法於民國八十七年修正生效前,係採獨立課稅制及相對應的法人人格採法人實在說,但修正生效後,改採合併課稅制(即所謂兩稅合一制)及相對應的法人虛擬說。依新制,法人階段課徵的營利事業所得稅,於盈餘分配至個人股東時可扣抵其綜合所得稅。因此就新制而論,原稅法中對個人租稅優惠之規定,諸如土地交易所得及拆遷補償費免稅規定,對法人個人股東不應有差別待遇。


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